«Манхэттен» – это название сверхсекретного американского проекта, в результате которого в 1945-м году была разработана первая в мире атомная бомба, которая была сброшена на Японию.

Этот сериал снят в жанре научной драмы. В центре сюжета находится группа учёных, под руководством профессора Фрэнка Уинтера. Эта команда в всехсекретных лабораториях разрабатывает атомное оружие. Эти люди находятся под постоянным надзором и осознанием того, какого монстра они создают.

Их детище под названием «Малыш» будет сброшено на два города: Хиросиму и Нагасаки. при этом сотни тысяч людей погибнут.